El microbioma modula el impacto de la dieta en humanos y ratones. Este estudio evalúa las relaciones entre el metagenoma del microbioma intestinal e perros, humanos, ratones y cerdos. A partir de un catálogo de más de 1,2 millones de genes del microbioma intestinal canino y el perfil de abundancia taxonómica, se demostró que el microbioma canino es más parecido al de los humanos que al de cerdos o ratones. Intervenciones aleatorias con dietas ricas en proteína y bajas en hidratos de carbono frente a bajas en proteína y ricas en hidratos de carbono confirmaron que la dieta ejerce un extenso efecto reproducible sobre el microbioma canino independientemente de la raza y sexo. Los perros con sobrepeso u obesidad sufren unos cambios más extensos del microbioma en respuesta a una dieta rica en proteína que los perros magros.