Este artículo revisa las interacciones entre la dieta, microbiota digestiva y salud humana (pediátrica y en adultos) bajo el abordaje de la biología de sistemas, explorando cómo los macro y micronutrientes tales como ácidos grasos de cadena corta, ácidos biliares y compuestos amina y aromáticos son cometabolizados por los humanos y su microbiota simbiótica digestiva.